MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Microcoleus sp. PCC 7113 plasmid pMIC7113.05

Total Repeats: 84

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019741	AGT	2	6	190	195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019741	CAAAA	2	10	494	503	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_019741	A	6	6	500	505	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019741	GAA	2	6	583	588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019741	GTA	2	6	625	630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019741	TAC	2	6	641	646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_019741	CATG	2	8	650	657	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_019741	CTC	2	6	690	695	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_019741	CT	3	6	697	702	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_019741	CGA	2	6	737	742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_019741	ATT	2	6	743	748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019741	CTT	2	6	752	757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_019741	TGG	2	6	3102	3107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019741	ATAA	2	8	3119	3126	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019741	CTTT	2	8	3131	3138	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_019741	ACA	2	6	3171	3176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_019741	TC	3	6	4103	4108	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_019741	CAG	2	6	4124	4129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_019741	AGC	2	6	4173	4178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_019741	CAA	2	6	4265	4270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_019741	AAT	2	6	4286	4291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019741	A	6	6	4297	4302	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019741	TAG	2	6	4361	4366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019741	GCCA	2	8	5216	5223	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_019741	GGA	2	6	5232	5237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019741	TGA	2	6	5239	5244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019741	G	6	6	5250	5255	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019741	GGTTG	2	10	5378	5387	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019741	GCC	2	6	5411	5416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_019741	CAA	2	6	5448	5453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_019741	CT	3	6	5469	5474	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_019741	CTG	2	6	6340	6345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_019741	CTG	2	6	6357	6362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_019741	TA	3	6	6377	6382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019741	TAGA	2	8	6406	6413	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019741	GTT	2	6	8126	8131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019741	TTG	2	6	9470	9475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019741	CAA	2	6	9490	9495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_019741	ATC	2	6	9513	9518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_019741	ACC	2	6	9574	9579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_019741	AGA	2	6	9604	9609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019741	A	6	6	9662	9667	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019741	GTG	2	6	11864	11869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019741	TGGT	2	8	11960	11967	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019741	GAAG	2	8	12062	12069	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019741	CAA	2	6	12079	12084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_019741	TCG	2	6	12131	12136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_019741	A	6	6	12158	12163	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019741	CTTT	2	8	13439	13446	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_019741	CAA	2	6	13470	13475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_019741	AAAAT	2	10	13584	13593	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019741	T	6	6	13603	13608	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019741	A	8	8	13615	13622	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019741	TAT	2	6	13659	13664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019741	TTA	2	6	13674	13679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019741	AACTC	2	10	13707	13716	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
57	NC_019741	CCT	2	6	14084	14089	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_019741	CCA	2	6	14096	14101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_019741	TCC	2	6	17677	17682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_019741	GGA	2	6	17695	17700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019741	TGA	2	6	17715	17720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019741	A	7	7	17733	17739	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019741	CCT	2	6	17811	17816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_019741	TTTC	2	8	17873	17880	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_019741	GATG	2	8	17905	17912	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019741	T	6	6	17924	17929	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019741	T	7	7	22883	22889	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019741	A	7	7	24861	24867	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019741	ATG	2	6	24888	24893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019741	G	7	7	24911	24917	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019741	AT	3	6	26149	26154	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019741	TCA	2	6	26233	26238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_019741	TAA	3	9	26280	26288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019741	TAG	2	6	26292	26297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019741	TGA	2	6	26306	26311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019741	GA	3	6	26314	26319	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019741	GCC	2	6	26320	26325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_019741	CT	3	6	26334	26339	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_019741	T	9	9	26342	26350	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019741	AGA	2	6	26419	26424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019741	AGC	2	6	26703	26708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_019741	TAG	2	6	26760	26765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019741	GGC	2	6	28023	28028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_019741	GTAAC	2	10	28050	28059	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.